2018年9月5日，由深圳市内容中心网络与区块链要点试验室、我国核算机学会青年核算机科技论坛深圳（CCF Young Computer Scientists & Engineers Forum，简称为YOCSEF）一起承办的学术报告共享沟通会在北京大学深圳研讨生院举行。
本次沟通会上，生物信息学科学家Stephen J. Song和哈尔滨工业大学核算机科学学院副教授汤步州别离就 《人工智能在生药大数据中序列标示问题的要害运用》、《我国临床自然言语处理：研讨现状与应战》两大主题做主题讲演。
据了解，YOCSEF是由我国核算机学会(CCF)于1998年创立的系列性学术活动，总部设在北京，已在上海、杭州、长沙、成都、姑苏、西安、深圳、南京、昆明等26个城市建立了分论坛，每年活动数百次，活动方式首要包含：专题论坛、学术报告会、学术点评、评奖、扶贫助教等。
AI+生物信息学，助力生物蛋白序列标示
广义的生物信息学是一门致力于开发新的办法或软件以协助研讨者加深对生物学数据了解的交叉学科，触及核算机、生物学、数学与统计学以及工程学等学科类别, 要点在于集成各种算法和异构数据源的核算结构/办法/渠道。从信息科学技能的视点来看,生物信息学的研讨是一个从“数据”到“发现”的进程。
现在，功用被充沛表征的基因产品（蛋白）的数量与底子没有功用注释的基因产品（蛋白）的数量之间的距离越来越大。断定蛋白质功用的试验技能往往是贵重且耗时的。当AI与生物信息学相碰撞时，根据机器学习的人工智能能够运用到猜测蛋白质的柔性和无序区域、猜测蛋白酶特异性靶切开位点、猜测细菌排泄效应蛋白、猜测酶催化残基、猜测单个氨基酸多态性的功用影响等多个方面。
在会上，Stephen J. Song博士介绍了他们开发的一种名为Bastion4的生物信息学办法，首要采用了根据多种机器学习分类器集成学习算法，用来猜测T4SE序列。一般的机器学习的练习办法包含练习集、测验集和验证集，Bastion4的数据集包含了390个阳性T4SE序列和1112个阴性非T4SE序列，期间采用了CD-HIT程序用于去除高度同源的序列以防止模型练习中的潜在误差。
据了解，这种新算法的优点在于：
（1）与经过组合各种特征练习的单个模型比较，运用单个特征练习的单个模型的集成模型显着地改进了猜测作用;
（2）根据具有不同单一特征的集成学习模型猜测的大都表决战略，猜测成果更为安稳和精确。
Stephen J. Song表明，根据机器学习的结构一般可用于根据序列数据处理其他蛋白质、 DNA 、 RNA序列表征问题。
此外，Stephen J. Song还提出了一种称为PREvaIL的新核算办法，该办法结合了互补的序列、结构以及网络特征，用于判定具有3D结构信息但尚未在功用上表征的结构基因组学靶蛋白的功用残基。
Stephen J. Song是澳大利亚蒙纳士大学生物医学发现研讨所癌症与感染与免疫项目的高档研讨员和团队负责人，是核算生物医学、数据发掘、机器学习和蛋白质组学的生物信息学和数据科学家。
当答复亿欧记者怎么处理模型的泛化问题时，Stephen J. Song表明，这与研讨的数据集和所挑选的试验办法有关，一些具有特定特点的样本会相对易于检测，而别的一些则难以被检测出来。
NLP助力临床医疗文本处理
跟着电子病历的敏捷遍及和医疗大数据年代的到来，自然言语处理技能（简称NLP）在生物医学范畴敏捷开展，现已成为当时的研讨热门。所谓NLP技能，就是用机器来处理人类赖以沟通的书写文字和口头言语。它使用言语学和统计学，加上机器学习，以便在自动化效劳中对言语进行建模。
现在，临床医学信息大多以非结构化（或半结构化）文本方式存储于信息系统中，NLP是从医疗文本中提取有用信息的要害技能。经过自然言语处理，如语句的分词，实体辨认，实体的归一化和链接等，这些非结构化的医疗文本能够被转化为包含重要医学信息的核算机能够进行核算的结构化数据，有助于科研人员从结构化的数据中发现有用医学信息，然后进步医疗系统的运转质量，削减运转本钱。
在沟通会上，汤步州首要共享了医疗范畴中的自然言语处理问题及相关技能，经过自身在中文临床医疗自然言语处理方面的一些研讨工作，讨论中文临床医疗文本处理当时所面对的问题与应战。
汤步州是深圳哈尔滨工业大学核算机科学学院副教授，一起也是我国核算机学会会员，人工智能学会青年工作委员会委员。近年来，他在重要世界期刊和会议上宣布学术论文近60篇，其间SCI/EI检索论文40多篇，他的研讨方向首要包含机器学习，数据发掘，自然言语处理，信号处理和医学信息学等。
现在汤步州现已开发了中文Clinical NLP东西，能够做到分词、词性标示、临床医疗实体辨认、时刻信息抽取和标准化别离以及临床医疗实体标准化，后续还会进一步开发临床医疗实体及特点抽取、隐私信息抽取等。
近年来，粤港澳大湾区在打造立异驱动新引擎，科技立异带动资源集聚等方面着力颇多，立异机制、工业晋级、人才引流、协同开展等带来了多方面的机会。相应的，人工智能、人才赋能正深刻地影响着商业脚步。
2018年10月18-19日，亿欧将在深圳举行“引擎·引领” 2018大湾区世界科创峰会（BATi），调集智能制作、智能产品、才智城市、才智安防、才智交通等一众热门问题打开讨论，剖析科技立异未来趋势，盘点技能革命下的开展关键。
